无菌室应定期用70%酒精或0.5%苯酚喷雾降尘和消毒,用2%新洁尔灭抹拭台面和用具70%酒精也可,用福尔马林40%甲醛加少量高锰酸钾定期密闭熏蒸,配合紫外线灭菌灯每次开启15分钟以上等等消毒灭菌手段,以使无菌室经常保持高度的无菌状态。接种箱内部也应装有紫外线灯,使用前开灯15分钟以上照射灭菌,但凡是照射不到之处仍是有菌的。在紫外线灯开启时间较长时,可激发空气中的氧分子缔合成臭氧分子,这种气体成分有很强的杀菌作用,可以对紫外线没有直接照到的角落产生灭菌效果。由于臭氧有碍健康,在进入操作之前应先关掉紫外线灯,关后十多分钟即可入内。
在超净工作台上亦可吊装紫外线灯,但应装在照明灯罩之外,并错开照明灯平行排列,这样在工作时不妨碍照明。若将紫外线灯装入照明灯罩玻璃板里面,这是毫无用处的,因为紫外线不能穿透玻璃,它的灯管是石英玻璃,而不是硅酸盐玻璃制成的。